Den 1 januari 2001 slogs Köpings Hamn AB och Västerås Hamn AB samman och bildade ett bolag, Mälarhamnar AB. Omsättningen för Mälarhamnar AB uppgick till 3 miljoner ton, varav cirka 75 procent är importgods. Ett betydande inslag i godshanteringen är importen av råvaror till stålindustrin i Bergslagen. Ett annat betydande godsslag är importen av bränslen för kraftvärmeverken i regionen. Båda hamnarna är kvalitetssäkrade enligt ISO 9000-2000 och miljöcertifierade enligt ISO 14001.
Det helägda dotterbolaget, Mälarhamnar Försäljnings AB, ansvarar för alla kundkontakter samt administrerar terminalverksamheten med införtullningar och fraktsedlar.